南红玛瑙以颜色优劣可逐次分为锦红、柿子红、樱桃红、红白料、缟红料和水透料等。天然南红玛瑙的色泽鲜润、纯正、厚重、协调，通常来说假南红玛瑙的色和光都不自然，往往艳丽轻浮。
南红玛瑙的颜色：锦红是南红中颜色最好的，色泽红如锦，以大红色、正红为主，包括名贵的柿子红。
樱桃红略带黄色，犹如樱桃一般，因此得名。
朱砂红其红色由无数细密的朱砂点聚集成。
红白料是红色与白色相间， 以红白分明最珍贵。
缟红料因为有类似红缟纹理而得名。
天然南红玛瑙是胶质感的，就算全红的珠子也不是不透光的。即便是无色的南红珠子，用肉眼观察时，也会有种朦胧的感觉，类似和田玉般的油润感。南红玛瑙用灯打光会有肉眼能看到的一颗颗密集的、犹如面粉物质的粉状物质结构，这就是南红玛瑙之中的朱砂，也是其独有特点。
南红玛瑙的纹路比较清晰，像丝带一样，所有的纹路在转折时都会有明显的角度，给人一种干净利索的感觉，这也是南红玛瑙独具特色的地方。假的南红玛瑙就会在裂纹处出现一些火烧的痕迹，这其实还是比较容易看出来的。
