1、天然南红玛瑙颜色纯正，色泽鲜润具活性感、纯正、厚重、协调。颜色太红非常的鲜艳，遇到这种颜色大家要注意了，目前大多数的南红玛瑙颜色不是正红，南红颜色很难达到百分百的正红，即便是锦红也会有部分或局部颜色偏差。如果感觉太红的话也要小心了，要知道一点瑕疵都没有的实在是太稀有了。
2、天然南红玛瑙，不透明有朦胧感。
南红玛瑙的透明度并不高，大多是不透明的，有的能看见自然水线或“云彩”或“丝絮”状结构，是一种胶状的形态，就算是无色的南红玛瑙也不会很透明，会有着一层朦胧感。而烧色玛瑙和合成玻璃的透明度都十分优秀，有的甚至完全透明，十分不自然;
3、南红玛瑙的纹路比较清晰，在纹路中间也没有粉末状或者是一些杂色，但是假的南红玛瑙就会在裂纹处出现一些火烧的痕迹，这其实还是比较容易看出来的。另外，南红玛瑙在时间的推移之下会产生风化的情况，从而产生月牙状的风化纹，但是假的就不会有。
4、南红玛瑙的打孔很有特点，可能为大料先双面打孔再出珠(孔不会很小)，在经过长时间的使用所以，孔内因为磨损十分光滑，如果发现孔内有明显螺旋纹而且有白色粉末状，即可判定有新工或染色南红的嫌疑。
5、朱砂点是南红玛瑙独有的特点，南红玛瑙的红色就是主要有细密的朱砂点汇聚而成的，一般四川凉山九口等地区产的南红肉眼是看不出朱砂点的，而云南保山地区的南红和凉山联合地区的南红朱砂点较为明显。
如果是肉眼能看得到的朱砂点，一般都是红白料那种，或者比较透的，那么基本就是天然南红玛瑙了，而那些颜色均匀，色泽红艳的在借助高倍放大镜或者显微镜下来观察还是可以看到朱砂点的，这些朱砂点会分布的非常均匀并且非常细密。
